Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms