Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms