Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNSTRNQ9Y448 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms