Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HCN4Q9Y3Q4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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