Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms