Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms