Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD4AQ9UPU9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms