Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms