Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms