Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA3Q9UI47 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms