Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT172Q9UG01 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms