Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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