Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NLKQ9UBE8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms