Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms