Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RDH8Q9NYR8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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