Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms