Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRT84Q9NSB2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT84Q9NSB2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms