Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP4Q9NRJ4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms