Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCL3Q9H2J4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDCL3Q9H2J4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDCL3Q9H2J4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCL3Q9H2J4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms