Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms