Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF518BQ9C0D4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF518BQ9C0D4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms