Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms