Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms