Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRCC1Q9C099 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms