Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms