Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2AFJQ9BTM1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms