Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms