Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AKAP9Q99996 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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