Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms