Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms