Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms