Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms