Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms