Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms