Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms