Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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