Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms