Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS3Q969F9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms