Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-CQ95604 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms