Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms