Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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