Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms