Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms