Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms