Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms