Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms