Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C17orf47Q8NEP4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms