Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms