Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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