Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms